11 Ağustos 1988 yılında dünyaya gelen Milli futbolcu santrafor mevkiinde görev almaktadır. Mustafa Pektemek ilk transferini okul takımı ile katılmış olduğu turnuvada amatör takımlardan Topağaçspor’a gerçekleştirmiştir.
Profesyonel futbol yaşantısına 2006 yılında Sakaryaspor takımı ile adım atmış 1 sene Sarıyerspor’da kiralık olarak forma giymiştir. 2008 yılında Gençlerbirliği, 2011 yılındada 4 Milyon Euro bonservis bedeli ile Beşiktaş takımına transfer olmuştur. 2016 yılında Başakşehirspor takımına kiralanmış 2017 sezonunda Beşiktaş’a geri dönmüştür.
Bugüne kadar toplam 12 kez Türkiye A Milli Takım formasını giymiş 1 gol atmıştır. Ayrıca U19, U21 ve Türkiye A2 Mill formalarınıda toplam 27 kez giymiş 3 gol kaydetmiştir.
Mustafa Pektemek aslen Sakarya Akyazı’lıdır. 2015 yılında Ayşe Sena Aksoyman ile evlenmiştir.