1979 yılında Fenerbahçe U21 takımına dahil olduğu seneden itibaren jübile yaptığı 1 Temmuz 1995 tarihine kadar Fenerbahçe formasını giymiştir. Kariyeri boyunca Fenerbahçe dışında hiç bir takımda forma giymeyen Müjdat Yetkiner, Türkiye A Milli takım formasını ise toplam 26 kez giymiştir.
Fenerbahçe forması ile bir çok kez Türkiye Kupası, UEFA Kupası, Avrupa Şampiyon Kulüpler Kupası ve Süper Lig karşılaşmalarında yer almıştır. Miço lakabı ile futbol severlerin gönlünde taht kurmuş, uzun süre takımın kaptanlık görevini üstlenmiştir.
Futbol kariyerinin ardından kulüpte Futbol Altyapı Gençlik Geliştirme Programı Koordinatörü olarak uzun seneler çalışmıştır. Bbaşkanlık görevine Ali Koç’un seçilmesinin ardından kulüpten gönderilmesine karar verilmiştir.
1962 yılında İstanbul’da dünyaya gelen Müjdat Yetkiner, aslen Çankırı’lıdır.