İsmail Hakkı Pekin Kara Harp Okulundan 1972 yılında mezun olmuş, ardından Piyade Okulunu tamamlamıştır.
1973 ve 1982 seneleri arasında Hava İndirme Tugayı, 7. Hudut Taburu, Dağ Komando Okulu ve Eğitim Merkezi komutanlığı görevini üstlenmiştir. 1974’de Hava İndirme Tugayı 1. Paraşüt Taburunda takım komutanı olarak Kıbrıs Barış Harekatın’da yer almıştır. 1984 senesinde Kara Harp Akademisinden mezun olmuş 3 sene 61. Piyade Tümeninde Harekat Eğitim Şube Müdürlüğü yapmıştır.
1987’de ise Silahlı Kuvvetler Akademisi’ni tamamlayan İsmail Hakkı Pekin 1987 ve 1991 Kara Kuvvetleri Eğitim Komutanlığı, 1991 ve 1994 Brüksel TMR Başkanlığı Kara Plan Subayı, 1994 ve 1995 1. Mekanize Piyade Tugayı Kurmay Başkanlığı, 1995 ve 1997 5. Hudut Alay Komutanlığı, 1997 ve 1998 Kara Kuvvetleri Genel Plan Prensipler Savunma Araştırma Şube Müdürlüğü yapmıştır.
1998 yılının 30 Ağustosunda Tuğgeneralliğe yükselen İsmail Hakkı Pekin daha sonra 1998 ve 2000 Kara Kuvvetleri Plan Harekat ve Teşkilat Daire Başkanlığı, 2000 ve 2002 yılları arasında ise 66. Zırhlı Tugay Komutanlığı görevlerini üstlenmiş ve 30 Ağustos 2002 yılında Tümgeneral olmuştur.
Tümgeneral olarak 2002 ve 2005 Kara Kuvvetleri Personel Başkanlığı, 2005 ve 2006 4. Kolordu Komutan Yardımcılığı ve 1. Mekanize Piyade Tümen Komutanlığı görevlerini üstlenmiş 30 Ağustos 2006 yılında Korgeneral olmuştur.
Korgenaral rütbesi ile 2006 ve 2007 arası 8. Kolordu Komutanlığı ve Genel Kurmay İstihbarat Başkanlığı görevine atanmıştır. Kıbrıs Bronz Liyakat madalyası’na sahiptir. Eşi Nevin Hanım’dır bu evliliğinden iki evladı vardır. İyi derecede İngilizce bilen İsmail Hakkı Pekin 1951 yılında Bursa İznik’te dünyaya gelmiştir.
Ulusal Kanal, Aydınlık gazetesi, Kaynak Yayınları ve Teori dergisi şirketlerinin medya grup başkanlığı’nı yapmış daha sonra bu görevlerinden ayrılmıştır. Vatan Partisi ile siyasi hayatına başlamış, 2015 yılında ise İşçi Partisine üye olmuştur.