İhsan Fazlıoğlu Kadıköy İmam Hatip Lisesi ardından, İstanbul Üniversitesi Felsefe Bölümü’nden mezun olmuştur. Ürdün Üniversitesi’nde ve Arap Bilim Tarihi Enstitüsü’nde bilim ve matematik tarihi üzerinde araştırmalar yapmış, İstanbul Üniversitesi’nde Yüksek Lisans, Doktorasını ise Felsefe bölümü üzerine tamamlamıştır.
2001 ve 2002 yıllarında Oklahoma Üniversitesi’nde alanı ile ilgili araştırmalar yapan İhsan Fazlıoğlu 2005 yılında Doçent olmuştur.
McGill Üniversitesi, İslam Araştırmaları Enstitüsü’nde misafir öğretim üyesi olarak bulunmuş, proje danışmanlığı yaptı ve kıdemli araştırmacı olarak çalışmıştır.
Günümüzde İstanbul Medeniyet Üniversitesi, Edebiyat Fakültesi, Felsefe Bölümü’nde öğretim üyesi olarak çalışmalarını sürdürmektedir.
İhsan Fazlıoğlu aslen Trabzon Of’ludur.