Gökhan Erün İstanbul Erkek Lisesi mezunudur. Lise eğitiminin ardından İstanbul Teknik Üniversitesi Elektronik ve Haberleşme Bölümünde Lisans eğitimini, Yeditepe Üniversitesi İşletme Bölümünde Yüksek Lisans eğitimini tamamlamıştır.
1994 senesinnde Garanti Bankası Hazine Müdürlüğünde iş hayatına atılan Gökhan Erün 5 yıl Ticari Pazarlama Birim Müdürü olarak görev yapmıştır.
2004 yılında ise Garanti Emeklilik ve Hayat A.Ş Genel Müdürlüğüne atanmış bir sene sonra Garanti Bankası Genel Müdür Yardımcısı olmuştur.
2015 yılında ise Garanti Bankası Genel Müdür Vekili olarak görevini sürdürmüştür. 2017 yılında Yapı Kredi Bankası Genel Müdürlük görevine getirilmiştir.