Orgeneral Emin Alpkaya Kara Harp Okulu’nu Asteğmen rütbesi ile 1941 yılında tamamlamıştır. İngiltere’de Cronwell Uçuk Okulu’nda eğitim almış ve illerimizden Eskişehir’e 1. Tayyare Alayı’na atanarak mesleki hayatını sürdürmüştür. Daha sonra Korgeneral rütbesi ile Hava Kuvvetleri Kurmay Başkanlığı, CENTO Askeri Türk Temsilciliği ve 1. Taktik Hava Kuvveti Komutanlığı görevlerini sürdürmüştür. 1970 senesinde ise Orgeneral’liğe terfi eden Emin Alpkaya 1976 senesinde emekli olmuştur.
Emekliliğinin ardından Yapı Kredi Bankası Yönetim Kurulu Üyeliği ve Türkiye Büyük Millet Meclisi 17. Dönem Niğde Milletvekilliği yapmıştır. İngilizce bilen Emin Alpkaya’nın evliliğinden 2 evladı vardır. Türk Silahlı Kuvvetleri Üstün Hizmet Madalyası ödüllü Orgeneral Emin Alpkaya aslen Niğde’lidir. İstanbul Sarıyer İstinye Bağlar Mevkii’nde ismine ait Orgeneral Emin Alpkaya İlköğretim Okulu bulunmaktadır. 22 Mart 2015 yılında 66 yaşında iken İstanbul’da vefat etmiştir.